Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Elf3Q3UPW2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elf3Q3UPW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elf3Q3UPW2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms