Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nhlrc4Q3UP44 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc4Q3UP44 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms