Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrch2Q3UMG5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms