Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Washc4Q3UMB9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms