Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst1Q3UHN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndst1Q3UHN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndst1Q3UHN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndst1Q3UHN9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndst1Q3UHN9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms