Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc58Q3UGP9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc58Q3UGP9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc58Q3UGP9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc58Q3UGP9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms