Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms