Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft2Q3UF64 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft2Q3UF64 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms