Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trafd1Q3UDK1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms