Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rasip1Q3U0S6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasip1Q3U0S6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rasip1Q3U0S6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasip1Q3U0S6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms