Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms