Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map9Q3TRR0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Map9Q3TRR0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Map9Q3TRR0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map9Q3TRR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map9Q3TRR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms