Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TQQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TQQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TQQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms