Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdnep1Q3TP92 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms