Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Smarca4Q3TKT4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca4Q3TKT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca4Q3TKT4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca4Q3TKT4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms