Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp39Q3TIX9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp39Q3TIX9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms