Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hs1bp3Q3TC93 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hs1bp3Q3TC93 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms