Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms