Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riiad1Q3KNY5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms