Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl9Q32KG4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl9Q32KG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms