Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2aQ2TBE6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms