Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vax1Q2NKI2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms