Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chrna5Q2MKA5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms