Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr1Q2M3X8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr1Q2M3X8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms