Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp1aQ2LKU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms