Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkpd1Q0VF94 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkpd1Q0VF94 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms