Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2b3Q0VF55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b3Q0VF55 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms