Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb8Q0VBD0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb8Q0VBD0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms