Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5bQ0V8T8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms