Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cass4Q08EC4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cass4Q08EC4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms