Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Runx2Q08775 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Runx2Q08775 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Runx2Q08775 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 650.3 ms