Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp2Q08652 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp2Q08652 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms