Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgm3Q08189 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgm3Q08189 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms