Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn3Q07409 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn3Q07409 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms