Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atf4Q06507 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atf4Q06507 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atf4Q06507 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms