Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cab39Q06138 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cab39Q06138 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms