Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf9Q05BQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf9Q05BQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf9Q05BQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms