Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox12Q04890 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox12Q04890 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms