Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox8Q04886 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms