Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tff2Q03404 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms