Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx2Q03358 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx2Q03358 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms