Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col6a2Q02788 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Col6a2Q02788 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col6a2Q02788 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms