Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Muc1Q02496 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.2 ms