Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd1Q02242 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcd1Q02242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms