Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Snai1Q02085 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snai1Q02085 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snai1Q02085 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms