Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1cQ01815 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms