Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp1Q01514 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp1Q01514 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms