Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja5Q01231 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja5Q01231 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja5Q01231 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms