Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde1bQ01065 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde1bQ01065 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms