Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8a1Q00558 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
F8a1Q00558 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms