Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms